RNA上样Buffer常用指南「友名生物」

RNA抽取一般使用Trizol法抽提:

Trizol是一种总RNA抽提***，内含异硫qing酸胍等物质，能迅速裂解细胞，***细胞释放出的核酸酶活性。目前常用Trizol法进行提取***或细胞中的RNA。

Trizol作用原理:

在匀质化或溶解样品中，Trizol***可保持RNA的完整性，同时能***细胞及溶解细胞成分。加入氯1仿离心后，裂解液分层成水相和有机相。RNA存在于水相中。

水相转移后，RNA通过异丙1醇沉淀回收。移去水相后，用乙醇可从中间相沉淀得到DNA，加入异丙1醇沉淀可从有机相得到蛋白质。

总RNA的抽提方法:

目前常用的方法是用异硫qing酸胍苯1酚抽提法。

提取步骤:

先用液氮研磨材料，匀浆，加入Trizol***，进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯1仿抽提，离心，分离水相和有机相，收集含有RNA的水相，通过异丙1醇沉淀，获得比较纯的总RNA,用于下一步mRNA的纯化。也可将含有RNA样品的细胞破碎液通过硅胶膜纯化柱纯化。

RNA浓度和纯度判断:

OD260为1时相当于浓度为50 ug/mL;

OD260/0D280值在1.8~ 2.0之间，表示纯度较好;

0D260/OD280值低于1.8，样品有蛋白质或酚污染;

0D260/0D280值大于2.0，提取的RNA可能有降解;

电泳后如果rRNA大小完整，而且28S rRNA和18SrRNA亮度接近2:1、mRNA分布均匀，则认为RNA。

DNA提取过程中各种***的作用及原理

溶液II-NaOH-SDS液：NaOH：核酸在pH大于5，小于9的溶液中，是稳定的。但当pH>12或pH<3时，就会引起双链之间氢键的解离而变性。 在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L，加抽提液时，该系统的pH就高达12.6， 因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。

　　SDS：

　　SDS是离子型表面活性剂。它主要功能有：

　　(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白，因而溶解膜蛋白而***细胞膜。

　　(2)解聚细胞中的核蛋白。

　　(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物，使蛋白质变性而沉淀下来。 但是SDS能***核糖核酸酶的作用，所以在以后的提取过程中，必须把它去除干净，防止在下一步操作中 (用RNase去除RNA时)受到干扰。

提取DNA常用的方法

　　一.酚抽提法：先用蛋酶K、SDS破碎细胞，消化蛋白，然后用酚和酚-氯DNA大小为100-150kb

　　二.甲酰胺解聚法：破碎细胞同上，然后用高浓度甲酰胺解聚蛋白质与DNA的结合，再透析获得DNA可得DNA200kb左右。

　　三.玻璃棒缠绕法：用盐酸胍裂解细胞，将裂解物铺于乙醇上，然后用带钩或U型玻璃棒在界面轻搅，DNA沉淀液绕于玻棒。生成DNA约80kb。

　　四.异丙1醇沉淀法：基本同1法，仅用二倍容积异丙1醇替代乙醇，可去除小分子RNA(在异丙1醇中可溶状态)

　　五.表面活性剂快速制备法：用Triton X-100A或NP40表面活性剂破碎细胞，然后用蛋白酶K或酚去除蛋白，乙醇沉淀或透析。

　　六.加热法快速制备：加热96℃-100℃，五分钟，然后离心后取上清，可用于PCR反应。

　　七.碱变性快速制备：先用NaOH作用20分钟，再加HCI中和，离心后取上清，含少量DNA。