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粗提物定量PCR***服务为先 友名生物技术

发布时间:2022-03-01 03:07:23        








出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致,有时其条带更整齐,亮度更高。

引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。

靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个***组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有***或器材均应高压消毒。所用离心管及样进头等均应一次性使用。必要时,在加标本前,反应管和***用紫外线照射,以***存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。






原位PCR( in situ PCR)技术

原位PCR综合了PCR和原位杂交( Insitu hybridization, ISH)的优点是一种在***切片或细胞涂片上原位对特定的DNA或RNA进行扩增.再用特异性的探针原位杂交检测。原位PCR标本一般需先经化学固定,以保持***细胞的良好形态结构。细胞膜和核膜有一定的通透性,PCR扩增所需的各种成分可进入细胞内或核内。在原位对特定的DNA或RNA进行扩增。扩增产物由于分子量较大或互相交织,不易透过细胞膜向外弥散,故保留在原位。这样就很容易应用ISH将其检出,同时还可对目的DNA序列的***细胞进行形态学分析。





***分型

PCR可用于检测特定细胞或生物体中等位***的序列差异。例如,***敲除和敲入小鼠等生物的***分型[3]。引物对经设计位于目标区域侧翼,可根据是否存在扩增子及扩增子长度来检测遗传变异。


但是如果为了检测特定核苷酸突变,则必须对扩增的序列进行进一步分析。例如, PCR扩增子测序就是研究单核苷酸变异(SNVs)和单核苷酸多态性(SNP)的方法之一。强烈推荐使用高保真DNA聚合酶,以防止在PCR过程中引入多余的突变。

通过PCR进行***分型也是对***1症和遗传病中的 突变进行遗传分析的一个基本方式。





 PCR反应五要素

参加PCR反应的物质主要有五种即引物(PCR引物为DNA部分片段,细胞内DNA复1制的引物为一段RNA链)、酶、dNTP、模板和缓冲液(其中需要Mg2+)。

[PCR步骤]标准的PCR过程分为三步:

1.DNA变性(90°C-96*C): 双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA

2.退火(25C-65'C): 系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。

3.延伸(70°C-75*C): 在Taq酶(在72C左右,活性***佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的5'端→3'端延伸,合成与模板互补的DNA链。

每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是***佳也能在很短的时间内copy完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60°C -65C间进行,以减少一次升降温过程,提

高了反应速度。






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